Warning: Undefined array key "DOKU_PREFS" in /usr/share/dokuwiki/inc/common.php on line 2082
cluster:73 [DokuWiki]

DokuWiki

User Tools

Site Tools

Trace:
cluster:73

Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

Link to this comparison view

Both sides previous revision Previous revision
Next revision 		Previous revision
Next revision Both sides next revision
cluster:73 [2021/07/20 15:26]
hmeij07 [OneAPI] 		cluster:73 [2021/07/27 15:20]
hmeij07 [Miniconda3]
Line 254: Line 254:
  
 ** Due to technical limitations, the conda package does not support GPUs ** according to web site. You must build manual libraries for GPU, see "gallario CPU+GPU" section above ** Due to technical limitations, the conda package does not support GPUs ** according to web site. You must build manual libraries for GPU, see "gallario CPU+GPU" section above
 +
 +<code>
 +
 +source /share/apps/CENTOS7/amber/miniconda3/etc/profile.d/conda.sh
 +export PATH=/share/apps/CENTOS7/amber/miniconda3/bin:$PATH
 +export LD_LIBRARY_PATH=/share/apps/CENTOS7/amber/miniconda3/lib:$LD_LIBRARY_PATH
 +which mpirun python conda
 +
 +</code>
 +
  
 <code> <code>
Line 293: Line 303:
 numpy                     1.19.5                   pypi_0    pypi numpy                     1.19.5                   pypi_0    pypi
 time                      1.8                  h516909a_0    conda-forge time                      1.8                  h516909a_0    conda-forge
 +</code>
 +
 +For nwells/smithlab added
 +
 +<code>
 +
 +conda install -c schrodinger pymol-bundle
 +
 +    package                    |            build
 +    ---------------------------|-----------------
 +    apbs-1.5                   |       h14c3975_3         277 KB  schrodinger
 +    biopython-1.78             |   py38h7b6447c_0         2.1 MB
 +    bzip2-1.0.8                |       h516909a_3         398 KB  conda-forge
 +    collada2gltf-2.1.4         |       h6bb024c_0         3.2 MB  schrodinger
 +    conda-4.10.3               |   py38h578d9bd_0         3.1 MB  conda-forge
 +    curl-7.71.1                |       hbc83047_1         140 KB
 +    dbus-1.13.18               |       hb2f20db_0         504 KB
 +    expat-2.4.1                |       h2531618_2         168 KB
 +    fontconfig-2.13.1          |    he4413a7_1000         327 KB  conda-forge
 +    freemol-1.158              |             py_2           6 KB  schrodinger
 +    freetype-2.10.4            |       h7ca028e_0         912 KB  conda-forge
 +    glew-2.0.0                 |                0         660 KB  schrodinger
 +    glib-2.69.0                |       h5202010_0         1.7 MB
 +    gst-plugins-base-1.14.0    |       hbbd80ab_1         4.8 MB
 +    gstreamer-1.14.0           |       h28cd5cc_2         3.2 MB
 +    h5py-2.10.0                |nompi_py38hafa665b_105         1.1 MB  conda-forge
 +    hdf4-4.2.13                |       h3ca952b_2         714 KB
 +    hdf5-1.10.6                |nompi_h7c3c948_1111         3.1 MB  conda-forge
 +    icu-58.2                   |    hf484d3e_1000        22.6 MB  conda-forge
 +    jpeg-9d                    |       h36c2ea0_0         264 KB  conda-forge
 +    krb5-1.18.2                |       h173b8e3_0         1.3 MB
 +    libcurl-7.71.1             |       h20c2e04_1         305 KB
 +    libglu-9.0.0               |    he1b5a44_1001         413 KB  conda-forge
 +    libholoplaycore-0.1.0_rc4  |                1         325 KB  schrodinger
 +    libnetcdf-4.7.4            |nompi_h56d31a8_107         1.3 MB  conda-forge
 +    libpng-1.6.37              |       h21135ba_2         306 KB  conda-forge
 +    libssh2-1.9.0              |       hab1572f_5         225 KB  conda-forge
 +    libtiff-4.0.10             |    hc3755c2_1005         602 KB  conda-forge
 +    libuuid-2.32.1             |    h14c3975_1000          26 KB  conda-forge
 +    libxcb-1.13                |    h14c3975_1002         396 KB  conda-forge
 +    libxml2-2.9.10             |       hb55368b_3         1.2 MB
 +    lz4-c-1.9.2                |       he1b5a44_3         203 KB  conda-forge
 +    mengine-1                  |       h14c3975_1         676 KB  schrodinger
 +    mpeg_encode-1              |       h14c3975_1         106 KB  schrodinger
 +    mtz2ccp4_px-1.0            |       h9ac9557_3         547 KB  schrodinger
 +    olefile-0.46               |     pyh9f0ad1d_1          32 KB  conda-forge
 +    pcre-8.45                  |       h295c915_0         207 KB
 +    pdb2pqr-2.1.2+pymol        |             py_0         236 KB  schrodinger
 +    pillow-6.2.1               |   py38h6b7be26_0         637 KB  conda-forge
 +    pmw-2.0.1+3                |             py_3          60 KB  schrodinger
 +    pthread-stubs-0.4          |    h36c2ea0_1001           5 KB  conda-forge
 +    pycollada-0.7.1+bdf414c7   |             py_1          80 KB  schrodinger
 +    pykerberos-1.2.1           |   py38h27cfd23_2         259 KB
 +    pymol-2.4.1                |   py38h4463551_0         8.5 MB  schrodinger
 +    pymol-bundle-2.4.1         |                0          16 KB  schrodinger
 +    pymol-web-examples-2.4     |                1         1.9 MB  schrodinger
 +    pyqt-5.9.2                 |   py38h05f1152_4         4.5 MB
 +    qt-5.9.7                   |       h5867ecd_1        68.5 MB
 +    rigimol-1.3                |                2         489 KB  schrodinger
 +    sip-4.19.13                |   py38he6710b0_0         277 KB
 +    xorg-libxau-1.0.9          |       h14c3975_0          13 KB  conda-forge
 +    xorg-libxdmcp-1.1.3        |       h516909a_0          18 KB  conda-forge
 +    zstd-1.4.5                 |       h9ceee32_0         619 KB
 +
 +
 </code> </code>
  
cluster/73.txt ยท Last modified: 2024/02/16 11:17 by hmeij07

Page Tools

Except where otherwise noted, content on this wiki is licensed under the following license: CC Attribution-Share Alike 4.0 International
CC Attribution-Share Alike 4.0 International Donate Powered by PHP Valid HTML5 Valid CSS Driven by DokuWiki